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中國擁有最大樣本基數(shù) 缺乏標準化、集約化、共享化

來源:科技日報 2018-04-09 10:22 http://www.lxsnb.com/

擁有最大樣本基數(shù) 缺乏標準化、集約化、共享化

中國生物樣本庫:不能僅“存起來再說”

  “101篇1980年前后發(fā)表于《細胞》《自然》等雜志的重大發(fā)現(xiàn),20年后僅1項有臨床價值。”中國科學院院士、復旦大學附屬中山醫(yī)院院長樊嘉在近日召開的中國整合生物樣本學大會上說,美國的這組統(tǒng)計數(shù)字顯示從實驗室到臨床的傳統(tǒng)轉(zhuǎn)化模式效率低、時間長。

  高質(zhì)量論文僅有不足百分之一臨床轉(zhuǎn)化,這樣的窘境有望通過樣本庫的有效利用破解,擁有最多的患者群體和最復雜的疾病譜的中國樣本庫被寄予厚望。如何在豐富的臨床資源中建立能產(chǎn)生“研究價值”的樣本庫,成為學界關注焦點。

  “以前有些專家教授買幾個冰箱、存了點樣本就說自己建了一個樣本庫。”中國工程院院士、南開大學校長曹雪濤說,“用的時候卻發(fā)現(xiàn)是一個‘廢庫’、一個‘死庫’、一個沒有標準的庫,很難讓國際同行承認其具有充足價值。”

  上海分子醫(yī)學工程技術研究中心主任郜恒駿對“死庫”也不陌生,他描述道:“整潔白凈的超低溫冰箱、配上大小顏色各異的鎖頭,這些鎖的鑰匙在醫(yī)院的各科室主任手里,使用里面的樣本必須主任首肯。”

  行政割裂成為“死庫”難以活起來的主要原因。“和醫(yī)院關系好,就能在臨床研究的時候借用樣本庫中的樣本。”一位不愿透露姓名的研究人員說,他們的一項研究需要500例實驗組、800例對照組,需要多家樣本庫的支持,這就要和各家醫(yī)院分別商談。

  當下,樣本庫的所有使用權掌握在各家醫(yī)院手中,而不同醫(yī)院并沒有共享樣本庫的主動性和驅(qū)動力,除非是在合作研究項目中互換。

  顯而易見,“割據(jù)”難以形成大數(shù)據(jù)分析所需要的數(shù)據(jù)量,更會使樣本庫整體的發(fā)展落于人后。“樣本管理、設備更新等各方面工作均跟不上國際發(fā)展。”郜恒駿說,例如,國際上已經(jīng)在使用全自動的存儲系統(tǒng),全部取樣過程在深低溫下進行,而我國絕大多數(shù)樣本庫仍是人工取樣。“反復凍融對生物樣本的損傷很大,一些腦組織蛋白,在凍融后可能損失殆盡,將直接影響醫(yī)學研究結果。”

  為此,統(tǒng)一的標準正在形成中,全國生物樣本標準化技術委員會自2015年6月成立以來,已上報生物樣本庫的國家標準約30項,立項4項,并形成了送審稿。上海、深圳等地標準已經(jīng)發(fā)布,但并非強制性標準。

  2016年前后,在政府部門的支持下,生物芯片上海國家工程研究中心牽頭成立了上海張江生物銀行,定位為集約化的第三方存儲中心,擁有1000萬份生物樣本的儲存能力。2017年10月該銀行正式啟動,儲存了50萬份各種類型的樣本。

  “標準化、集約化、共享化”,在郜恒駿看來,生物銀行是樣本庫問題得以解決的好路徑:樣本經(jīng)過嚴格檢驗進入“銀行”、存儲系統(tǒng)是全自動化的最先進設備、還有專門的人員維護和技術支持。“建設和維護成本僅為獨立所有的十分之一甚至百分之一。”郜恒駿說,英國等國已有成功先例。

  這個解決之道,卻沒有被熱捧。截至目前,已有兩家醫(yī)院開放了自己的樣本“地盤”,進入銀行。部分醫(yī)院還在觀望。“上海張江生物銀行是一個備選,我們正在考慮。”在被記者問到是否將樣本放入張江生物銀行時,上海交通大學新華醫(yī)院的一位教授這樣回應。

  甚至更多的醫(yī)院還在建設樣本庫。“因為現(xiàn)在申請科研項目要有臨床研究部分,需要這方面的資質(zhì),所以我們最近承接了很多醫(yī)院的建設項目。”一位企業(yè)銷售人員表示。

  郜恒駿認為這樣的重復建設并不必要,發(fā)揮樣本最大價值的樣本庫架構應該是國家層面建總行,華中、華南、華北等區(qū)域以龍頭醫(yī)院為依托建分行,并在此基礎上探索合法合規(guī)的商業(yè)模式。

  然而當下的機制體制中,商業(yè)化發(fā)展模式似乎步履維艱。“中美是有差別的,美國以生物制藥公司為主導,他們是商業(yè)化的,注重利用;而中國以醫(yī)院為主導,他們更多是想‘存起來再說’。”上海交通大學新華醫(yī)院王偉業(yè)一語中的。

  中國特色的生物樣本庫價值化之路,仍需要更多的探索,行業(yè)協(xié)會組織中國醫(yī)藥生物技術協(xié)會組織生物樣本庫分會十年一劍,仍在推進。“中國生物樣本庫怎么做才是最好的?”郜恒駿這位有30年經(jīng)驗的樣本庫組織者、活動家表示,這個問號在他心中仍未被拉直。

  本報記者 張佳星

原標題:中國擁有最大樣本基數(shù) 缺乏標準化、集約化、共享化
責任編輯:鄭莉莉
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